Test RT-PCR de détection du SARS-CoV-2 sur les prélèvements nasopharyngés par les systèmes à cartouche : Comparaison entre les résultats des tests Truenat™ COVID-19 et Xpert® Xpress SARS-CoV-2 à l’ANSSEAT

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Résumé

Introduction. En réponse à la pandémie de la COVID-19, plusieurs tests RT-PCR rapides ont
été développés avec des performances diverses.
Objectif. L’objectif général de cette étude était de comparer les résultats de détection du SARS
CoV-2 avec le test Truenat™ COVID-19 de Molbio Diagnostics aux résultats du test Xpert®
Xpress SARS-CoV-2 de Cepheid.
Matériel & Méthodes. Au total 514 échantillons d’écouvillonnage nasopharyngé de voyageurs
ont été recueillis de juin à octobre 2022 à l’ANSSEAT à Ouagadougou. Ces échantillons ont
été simultanément analysés sur 2 plateformes à système fermé : le Truelab/Quattro et le
GeneXpert conformément aux instructions des fabricants.
Résultats. L’âge moyen des voyageurs était de 35,10±14.54 ans avec une prédominance
masculine (64 %). La Sensibilité et la Spécificité du test Truenat™ Covid-19 étaient
respectivement de 98 % et de 98,92 % avec une valeur prédictive positive (VPP) de 90,74% et
une Valeur prédictive négative (VPN) de 99,78%. Le Coefficient Kappa de Cohen était de 0,94.
Le biais était de 1,53 avec un intervalle d’agrément de 1,53±12,13.
Conclusion. Le Test Truenat™ COVID-19 de Molbio Diagnostics, simple et rapide
d’exécution, a montré une bonne performance dans la détection du SARS-CoV-2. Il peut donc
être recommandé aussi bien pour les tests voyageurs que pour le diagnostic et la surveillance
de la COVID-19 dans les formations sanitaires à ressources limitées.

Mots-clés

Truenat™ COVID-19, Xpert® Xpress SARS-CoV-2, écouvillonnage nasopharyngé, RT-PCR, ANSSEAT