L’étude de la diversité génétique des différentes espèces végétales permet une
meilleure conservation et une utilisation durable de leurs ressources
génétiques. L’objectif général de cette étude est de contribuer à une meilleure
connaissance de la diversité génétique de piment (Capsicum spp.) au Burkina
Faso. Ainsi, 59 accessions du piment ont été caractérisées au moyen de 12
marqueurs microsatellites nucléaires SSR. Les 12 marqueurs utilisés ont
présenté un taux de polymorphisme de 100 % pour la collection du piment
étudié et ont généré un total de 92 allèles avec une moyenne de 7,67 allèles
par locus. L’hétérozygotie observée a été majoritairement inférieure à
l’hétérozygotie attendue. En fonction des zones climatiques, les accessions du
secteur nord-soudanien ont présenté une diversité génétique élevée par rapport
aux accessions des secteurs Sud-soudanien et Sud-sahélien avec un nombre
d’allèles efficaces moyens de 4,31 allèles par locus. Les résultats de l’analyse
de variance moléculaire (AMOVA) montré qu’en plus de la contribution du
facteur accession dans l’expression de la variabilité génétique, le facteur zone
climatique intervient significativement dans la répartition des accessions du
piment étudié. Ainsi, la variabilité inter-secteurs phytogéographiques contribue
à elle seule pour 17 % de la variabilité totale. Les distances génétiques de Nei
calculées entre les secteurs phytogéographiques ont varié significativement
de 0,2 à 0,49 et le degré de différenciation génétique Fst a été modéré (compris
entre 0,11 et 0,14) entre ces secteurs phytogéographiques. La structuration
génétique avec les logiciels STRUCTURE 2.3.4. et DARwin V6.0., a été faite
en trois groupes indépendamment des secteurs phytogéographiques. Ces
résultats moléculaires qui ont montré une diversité génétique importante
pourront être exploités par les programmes de sélection et de conservation du
piment au Burkina Faso.

microsatellites SSR, Capsicum ssp., hétérozygotie, différenciation génétique, groupe génétique