Cette étude a permis l’analyse par les techniques PCR-DGGE, clonage et séquençage des échantillons
prélevés à différentes profondeurs de la colonne d’eau du lac Monoun. Les séquences récupérées ont été
réparties en six embranchements pour les bactéries. Les séquences étaient apparentées aux bactéries des
groupe Proteobactéries (63,7%), suivis des Chloroflexi et des Spirochaetes (12,1% chacun), puis des
Firmicutes (6,0%), et enfin de Bacteroidetes (3,0%) et Nitrospirae (3,0%). Quant aux séquences obtenues
avec l'amorce archée, elles s’apparentaient aux phyla Euryarchaeota (23,3%) et Thaumarchaeota (20,0%). La
proportion la plus élevée (56,7 %) ne correspondait pas avec des archées connues et a été qualifiée de non
classée. Une riche diversité microbienne susceptible d'inclure plusieurs nouveaux micro-organismes a été
révélée et les séquences d’ADN de procaryotes détectées déposées dans les banques de données GenBank
et du Japon.
La PCR quantitative absolue sur le gène ARNr 16S pour les bactéries et les archées a montré que les bactéries
étaient numériquement plus importantes que les archées dans tous les échantillons et que le nombre de
bactéries diminue, alors que celui des archées augmente avec la profondeur.

CO2-rich lake PCR-DGGE qPCR Prokaryotic communities Prokaryotic diversity Quantitative analyses