Evaluation de la diversité génétique de Striga gesnerioides (Willd.) Vatke à l’aide de marqueurs microsatellites au Burkina Faso,
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Auteur(s): Pingawindé SAWADOGO, Zakaria DIENI, Teyioué Benoit Joseph BATIENO, Nerbéwendé SAWADOGO, Jean Baptiste de la Salle TIGNEGRE, Tinga Jeremy OUEDRAOGO , Mahamadou SAWADOGO
Résumé

La structure génétique des populations d’adventices affecte l’efficacité des différentes stratégies de lutte. Cependant, bien que Striga gesnerioides soit un des handicaps majeurs à la production du niébé, peu d’études se sont intéressées à sa diversité génétique au niveau moléculaire. Au Burkina Faso, aucune étude de diversité génétique au niveau moléculaire sur Striga gesnerioides n'a encore été réalisée. D’où l’objectif de cette étude qui est de déterminer le niveau et la structuration de la diversité génétique du Striga gesnerioides à l’aide de marqueurs microsatellites. Ainsi, 36 marqueurs microsatellites ont été testés sur 30 écotypes de Striga gesnerioides. L’extraction de l’ADN a été effectuée en utilisant la technique des cartes FTA. La révélation des produits PCR a été réalisée par électrophorèse sur un gel d’agarose 3 %. L’étude a mis en évidence l’existence d’une diversité modérée au sein de la collection de Striga gesnerioides. En effet, l’indice de fixation très élevée (0,968), indique l’existence d’une forte consanguinité dans la collection de Striga gesnerioides. Les distances génétiques inter-zones agroclimatiques peu élevées indiqueraient des populations proches génétiquement. La classification ascendante hiérarchique, a permis l’identification de 3 groupes génétiques. L’observation des paramètres de diversité intra et interpopulation a montré que la structuration de la diversité est plus liée au facteur écotype qu’aux facteurs agroclimatique et race physiologique. L’étude a permis de révéler également des différences génétiques entre certaines races physiologiques. Les résultats de cette étude pourront contribuer à amorcer de nouvelles stratégies dans la sélection variétale du niébé pour la résistance au Striga gesnerioides.

Mots-clés

Striga gesnerioides diversité génétique cartes FTA ADN Marqueurs SSRs

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