Le gombo (Abelmoschus esculentus) est l’un des principaux légumes consommés au Burkina Faso. Cependant, sa diversité génétique reste peu connue sur le plan moléculaire, ce qui pourrait expliquer une sous exploitation et une faible valorisation des ressources génétiques du gombo. Dans un contexte de sélection variétale de ce légume, la détermination du profil de l’ADN est une approche moléculaire plus directe pour détecter et estimer les variations intra- et inter-populations. En vue de connaître la diversité génétique du gombo, une caractérisation moléculaire d’un core collection a été réalisée. Il s’est agi spécifiquement de déterminer les différents paramètres génétiques des génotypes retenus. Pour ce faire, 50 génotypes ont été caractérisées à l’aide de 19 marqueurs microsatellites spécifiques. L’extraction de l’ADN a été réalisée en utilisant la technologie FTA, suivi de l’amplification PCR et de la révélation. Les paramètres génétiques ont été calculés avec les logiciels GenALEx version 6.501 et DARwin 6 dans le but d’évaluer la diversité et la structure de l’ensemble de la collection. Les résultats ont montré que tous les marqueurs utilisés ont été amplifiés à des différentes régions de l’ADN. Au total de 34 allèles ont été identifiés dont 3 allèles rares pouvant être associés à des facteurs environnementaux. Le PIC est compris entre 0,11 et 0,86, l’hétérozygotie moyenne attendue et l’indice de diversité de Shannon ont été respectivement de 0,46 et 0,77. La diversité génétique selon l’algorithme de « Neighbor-Joining » a permis de structurer les accessions en trois groupes. La distance génétique de Nei varie entre 0,027 et 0,087 ; les indices de similitudes des accessions entre zones climatiques varient de 88% à 95% et de 83% à 95% entre groupes ethniques. Cette diversité génétique mise en évidence pourrait être exploitée dans le cadre d’un programme de conservation, de sélection et d’amélioration du gombo.

Gombo variabilité génétique marqueurs SSRs paramètres génétiques